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核酸提取瓶颈不再:直扩PCR技术,高效锁定目标基因

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在科研工作中,大家或许都有过类似经历:面对一批实验小鼠,必须依次对其实施解剖,精细分离各种组织器官,继而提取DNA并经过纯化程序,再进行PCR扩增,直至完成电泳检测分析。如此复杂的流程常常耗时超过一天,而这一切努力的目标仅仅是确认小鼠DNA中是否包含特定目标基因。其中,DNA提取和纯化步骤堪称冗长繁杂。现在有一个问题值得探究:是否有捷径可以绕过这些步骤,直接检验目标基因呢?这里,小翌为您推荐一项创新的PCR技术——直扩PCR,它能有效地帮助您应对这一挑战,简化实验过程

直接PCR(Direct PCR)是一种特殊的聚合酶链反应(PCR)技术,无需经过核酸提取纯化步骤,即可运用植物、动物组织、血液等未经处理的原始样本进行PCR扩增。相较于依赖严格纯化核酸的传统PCR方法,直接PCR摒弃了耗时的提取阶段,极大程度地简化实验流程,缩短实验时间,加快实验进度,并减小了在提取过程中可能引入的污染风险。其核心技术特征在于采用了对样本内抑制物质具有 抵抗性的聚合酶,确保即使在未经纯化的样本环境中,模板DNA也能成功释放并在PCR反应体系中有效扩增,从而为DNA扩增提供了 的简易途径。

图1. 直扩PCR与传统PCR技术比对图

翌圣生物研发的直扩PCR系列具有优秀的耐受抑制组分,有针对如动物、植物组织等不同样本的PCR产品,无需核酸提取纯化,助力快速检测。从样本开始,以未经基因组纯化的微量原始样本(图1-A)或其裂解产物(图1-B)作为模板,进行PCR-based Genotyping(见图1)。与常规PCR-based Genotyping相比,直接PCR试剂盒样本用量少,操作简单,实验成本低,可高通量化样本检测。

图2. 直扩PCR扩增流程图

A.直接法:取少量样本直接加入到PCR Master Mix中,进行PCR鉴定;

B.裂解法:样本取样后,加入裂解液中,裂解释放基因组,取少量裂解上清液加入到PCR Master Mix中,进行PCR鉴定。

明星产品推荐

植物直扩PCR(10187ES)

适用样本:水稻、大豆、玉米、拟南芥等植物的叶片、种子

产品优势:裂解时间仅需0-10 min

  • 不同类型植物叶片扩增效率高

图3. 使用Plant Tissue PCR Kit (With Dye)扩增不同类型植物叶片结果。M:100 bp DNA ladder。C:相应植物纯化基因组DNA为模板。1-2:叶片组织裂解产物为模板。循环数:30个循环。

血液直扩PCR(10188ES)

适用样本:含EDTA、肝素、柠檬酸盐等常规抗凝剂的新鲜血液、冷藏(冻)血液及Whatman903®和FTA®商用干

产品优势:扩增速度快,仅需3-10 sec/kb

  • 扩增长度高达8 kb

图4. 使用Blood Advanced Direct PCR Kit直接从人全血中扩增不同长度DNA片段。血样为-20℃储存的EDTA抗凝血,血液模板浓度为10%,延伸时间设置10 sec/kb。M为10510ES60(Yeasen)。

  • 耐受性强

图5 A. 使用Blood Advanced Direct PCR Kit直接从人EDTA抗凝全血中扩增2 kb长度、GC含量71%的DNA片段。血液模板浓度设置梯度0.5-50%,延伸时间为10 sec/kb。B. 使用Blood Advanced Direct PCR Kit直接从小鼠EDTA抗凝全血中扩增2.2 kb长度、GC含量67%的DNA片段。血液模板浓度设置0.5-50%,延伸时间为10 sec/kb。M为10510ES60(Yeasen)。

小鼠直扩PCR(10189ES)

适用样本:小鼠组织(如鼠尾、鼠耳、鼠趾等)

产品优势:对样本投入量要求低,仅需5 mg小鼠组织或1-5 mm鼠尾

  • 广泛的模板兼容性

图6. 使用Mouse Tissue Direct PCR Kit Plus直接裂解(70℃裂解10 min)扩增人293细胞、唾液、头皮组织,均有明显的目的条带,Marker: 10510ES60 (Yeasen).

  • 扩增速度及产量对比

1. 质粒 10189 1 kb11. 质粒 10189 2 kb

2. T品牌 鼠耳 1 kb12. T品牌鼠尾 2 kb

3. T品牌鼠尾 1 kb13. T品牌鼠耳 2 kb

4. T品牌鼠趾 1 kb14. T品牌鼠趾 2 kb

5-6. 10189 鼠耳 1 kb15-16. 10189 鼠耳 2 kb

7-8. 10189 鼠尾 1 kb17-18. 10189 鼠尾 2 kb

9-10. 10189 鼠趾 1 kb19-20. 10189 鼠趾 2 kb

图7. 使用Mouse Tissue Direct PCR Kit Plus和T品牌产品裂解不同组织扩增不同大小的目的片段,10189ES延伸速率为5 sec/kb,T品牌延伸速率60 sec/kb。(70℃裂解10 min)

结论:Mouse Tissue Direct PCR Kit Plus对不同组织裂解产物进行不同大小的目的片段扩增,在快速扩增的同时,均可达到产品定位的扩增效果,尤其是2 kb的扩增效果优于竞品。

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产品定位

产品名称

产品货号

规格

低投入量小鼠组织直扩PCR

Mouse Tissue Direct PCR Kit Plus

10189ES50/70

50 T/200 T

小鼠组织直扩PCR

Mouse Tissue Direct PCR Kit(With Dye) 小鼠组织直接PCR试剂盒

10185ES50/70

50 T/200 T

植物组织直扩PCR

Plant Tissue PCR Kit (With Dye)植物组织直接PCR试剂盒

10187ES50/70

50 T/200 T

血液直扩PCR,耐受不同抗凝剂

Blood Advanced Direct PCR Kit

10188ES50/70

50 T/200 T

增加PCR反应的灵敏度和特异性

PCR Enhancer PCR增强剂

10117ES03

1 mL

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